2017年3月17日，台南社大就召開記者會提出質疑，比對歷來空拍照片及套圖，發現2016年8月水利局核准歐欣的沉沙滯洪區已堆放砂包，反而阻擋上游野溪流動的動線；而在空拍的飛行過程中，仍可隱約看見溪水之反光，顯示此河段是有水的。然而2017年1月進行的空拍結果卻發現，此支流旁的林相被清除，支流完全被砂土覆蓋。質疑將此河道墊高的原因？破壞林相將牛埔溪之支流截流，這樣的滯洪工程的適切性與專業性何在？1
2017年12月28日，台南市水利局於網站公布南區（龍崎廠）事業廢棄物綜合處理中心核發施工許可說明如下：2
高雄路竹區的蓮溪埤，是二仁溪的滯洪區，腹地廣大，許多水鳥棲息。這裡曾是一塊美麗的溼地，也曾經被規劃為水庫，根據部落格「半竹野紀」的記載：
蓮溪埤位在路竹鄉最北邊的二層行溪畔，……很有可能就是二層行溪以前的河道，退化而成的牛軛湖，……蓮溪埤並無所謂上下游，水源應該多來自雨水及地勢影響而蒐集，現今蓮溪埤附近除埤塘外，還有廣大的溼地，也是白鷺聚居的場所，其可以灌溉的，應該也僅限於其週邊往北到二層行溪畔的農田。
蓮溪埤曾經被試圖規劃為水庫，不過後來似乎放棄了這項計畫，這項資訊可以參閱右側地名檢索系統的「高雄縣-路竹鄉-『連溪』」相關敘述：「由於蓮溪為本縣西北部一帶範圍最廣的一個淡水貯水窪地，在剛終戰後自來水尚未普及的時代，曾經被附近數鄉人士，委請臺灣省公共工程局（省住都局的前身），於民國52年規畫將之建為「蓮溪湖水庫」，計劃以二層行溪為水源，成立一個範圍含蓋茄萣、湖內、路竹、阿蓮、田寮等鄉的區域性自來水供水系統，但因所需工程費用龐大，財源籌措困難，以致未能付諸實現。」1
【環保團體聯合聲明稿】
申請於馬頭山開發掩埋場的富駿公司和其夥伴可寧衛公司，於8/14日在蘋果、自由等平面媒體頭版刊登一則聲明「掩埋場有錯嗎？」，抱怨該案環評審查三年多來，遭反對者使盡全力抗議，甚至屢屢訴諸司法加以阻擾。他們認為掩埋場是不可取代的環保設施，而該案開發「牽繫著台灣未來廢棄物最終妥善處理的命脈」；言下之意，希望取得政府和社會大眾支持，讓他們早日通過環評，儘速開發。在此先就富駿場區有無常態地下水、司法不起訴及馬頭山區域有無地下水，特反駁如下：
屏東縣枋寮鄉新龍村，是漁業署規劃的番仔崙養殖專區，台灣石斑產業的重要產地。原在外開店的陳右穎四年前回鄉，接手養殖。陳右穎說，番仔崙養殖專區養的魚種有石斑、龍膽石斑還有午仔魚，目前外銷以中國為主，年產值大概超過10億左右。由於外銷價高，當地居民幾乎全靠石斑魚維生。2018年3月起人和村1處魚塭，遭回填惡臭的不明廢土，整片土地滿溢噁心的泥臭味，旁邊的謝姓養殖戶更說，最近天氣開始變熱，他的魚塭鄰近廢土，深受其害，除了受到土方落塵影響，每天上百台砂石車經過，養殖的蝴蝶魚被震動嚇到不敢吃飼料，全部翻肚，一池就損失百餘萬元。魚塭旁的水池和塭堤盡是魚屍，在夏日高溫曝曬下，魚腥味非常難聞，自己養的3隻狗也不知為何陸續暴斃，令人驚恐。
2018年5月23日自由時報地記者陳彥廷有如下的報導：
2015年一隻海龜鼻孔卡管的影片，不但奪取全球淚光，引發更多人對海洋廢棄物的關注，也讓全球許多政府開始研議禁限用吸管的政策。而環保署今年提出的海廢治理行動方案中，也首打吸管，並於近日預告草案，打算自2019年七月起，禁止公部門、私立學校、百貨公司、賣場、連鎖速食店等之餐廳提供內用客人一次性「塑膠」吸管。此消息一出，立即引起社會上許多討論。環團大多認為，在餐廳內用時，吸管實在沒什麼必要性，因此應該禁止「任何材質」的一次性吸管，而非只是塑膠吸管；但環保署這次對生物可分解塑膠吸管、塗布塑膠薄膜的紙吸管網開一面，顯有為德不足之處。
龍崎，地處阿里山山脈尾端，是台南東南端的一個偏鄉，再往東或往南，就是高雄的內門與田寮，人口只約四千人，為台南市人口最少的行政區。在可考的歷史中，最早遷居至此的人類，是平埔族的西拉雅族的新港社人，因此它舊名「番社」，後在日治時期的1920年，取較大聚落龍船及崎頂之字，設置龍崎庄，是今日地名之由來。1
雖然對人類來說是偏鄉，但這裡有相當令人驚豔的景觀，也是不少生物棲居之所，卻於2003年被選為事業廢棄物綜合處理中心的場址所在，於是一連串爭議就此而起。
