核四廠進出水口預定地位於三貂灣，該地自民國67年起即被臺灣省漁業局劃定為「貢寮漁業資源保護區」，將九孔及龍蝦列為保護對象，一旦核四廠興建完工，其所運轉產生之溫排放水與具有放射性物質之排放物，均將對此地產生萬劫不復之嚴重影響。台電公司意欲對此區域進行工程，實應慎重重新進行「海域環境影響評估」，不應過渡草率執行，因環境破壞具有不可回復性。
對於「核四出水口潛式排放管工程」目前規畫為780公尺，但根據核四環境保護監督委員會第二十四次會議要求，台電目前正在研究延長排放管之可行性(見87年7月台電公司之核四廠計畫海域工程及漁業權補償說明資料)，既然台電公司對於核四廠排放管長度未定案，那台電所提之核能四廠海域工程專用漁業權補償金計算標準依據就無從根據，台電應將該工程規畫確定後，才能議論漁業權問題。
台電公司所提之「核能四廠發電計畫漁業補償評估研究報告」，內容缺少東北角自然生態資源資料，因「工程施工」及「溫排水」對海域影響不祇是反應在漁貨量上而已，包括鹽寮灣海域廣大不為人知的珊瑚礁群、包括約60種大型藻類、290種以上的貝類、70種以上的甲殼類、40種以上的棘皮動物及100種以上的海綿、海葵、水母、多毛類及海鞘等海濱生物，這些都是臺灣人民共有資產的嚴重損失，應列入評估標準。
台電公司所提之「核能四廠發電計畫漁業補償評估研究報告」乃係目的事業機關所委託規畫，已失去公正客觀的判斷，實為球員兼裁判的作法。我們要求應該採取「利益迴避」原則，請第三者重新委託進行研究報告。
根據行政院農委會漁業署於87年10月27日召開之核四廠海域漁業權座談會，其會議結論為「A.請台電公司多與漁民溝通。B.評估報告資料未齊全，應再做詳細評估計算，以免影響漁民權益。」因此有關單位應確實執行。
「核能四廠海域工程專用漁業權」議題應舉辦全鄉說明會，並請臺灣省漁業局提供相關法規及案例，以為漁民權益研究參考，且應提供經費作本會所屬海域生態調查，以示對海洋生態之最基本的生命尊重。
經濟部國營會已針對核能四廠漁業權補償召開過三次所謂”協調會”，因召集單位為經濟部，而非漁會之上級單位所召開，本會認為不合法定上之程序，故本會沒有參加，即無所謂”未達成補償協議”的結論。
在未取得當地漁會同意前，主管機關-行政院農委會及臺灣省漁業局，應暫緩處理經濟部國營會所提一切關於核能四廠海域工程專用漁業權補償事宜，否則引起的任何抗爭，行政院農委會及臺灣省漁業局就將成為罪魁禍首。
在未與貢寮區漁民充分溝通、取得同意及上述八項要求未具體處理前，臺灣省漁業局不得貿然強制撤銷貢寮區漁會之專用漁業權。且精省後，臺灣省漁業局無論合併或轉移於任何單位，亦應適用。