台電公司曾於1998年9月29日經由自由時報透露「核四建廠執照、最快十月核發」，在此反核團體-環保聯盟台北分會提出緊急呼籲：「原子能委員會基於法令程序正義及環境資源保護等理由，應暫緩發放核四廠建照」。以免帶來臺灣在土地及人文上的另一場浩劫。

基於以下理由：

1. 東北角風景特定區通盤檢討尚未通過。
2. 進出水口土地使用分區尚未變更為核四用地。
3. 核四廠進水口部份之石碇溪改道計畫未完成。
4. 核四廠區用水（包括廠區用水、稀釋淡化海水）的取得尚未核准。但因牽涉省水利處、自來水公司及水資源保護區之間的限制，取得不易。
5. 核廢料儲存原先申請並無規畫在內，如今卻變更計畫儲存於當地。（按環評法第16條規定：不得變更原申請內容。環評法施行細則第38條規定：開發單位變更原申請內容，應重新辦理環境影響評估）。
6. 原設計的機組類型、發電容量與目前招標機組不同，應重新辦理環境影響評估。
7. 核四廠區內有非常明顯的古文明文化遺址，為全民珍貴的文化資產。在尚未經過客觀公正的學術專家會同認定及尚未完整開挖之前，不應貿然發放建廠執照，破壞珍貴遺址。
8. 進出水口工程必須使用鹽寮灣海域，在台電公司尚未取得漁民之專屬漁業權之前，實不應發放實質建廠執照。
9. 台電公司於87年4月8日即進行「核四廠重件碼頭及進水口工程」，在鹽寮灣海岸大肆整地動工及放置大量消波塊，在建廠執照尚未取得前，實不尊重法律程序的行為，本會予以譴責並要求立即停工。